零代码绘出SCI级美图：景杰云平台绘图工具再上新！

高效准确的数据分析和可视化是将研究成果转化为高分SCI论文的关键一步。我们精心打造的景杰生信云平台自推出以来，凭借零代码、一站式、全流程的独特优势及详尽的云课堂资源，已成功助力了众多科研工作者突破生信分析瓶颈。

此前我们相继上线了四九象限图、多比较组差异散点图、富集弦图、聚类热图、修饰位点统计等多款交互绘图工具（点击链接详细阅读：每周一节生信实操课：多款科研绘图工具全新发布，绘出科学新高度！），为进一步赋能大家的科研创新，我们在已有的功能上，对平台的绘图能力进行了重磅升级！零代码，零基础，无门槛，所见即所得，让每位科研工作者都能轻松完成生信分析以及绘制SCI期刊级别的高质量图片，为您的科研文章发表保驾护航！

本次上线的工具包括：高级相关性分析、桑基气泡图、条形图、散点图、GSEAVis、icelogo、表格处理、序列处理等。所有绘图工具都支持png和pdf格式高清图片一键导出，图片质量完全符合期刊要求，让您的论文插图更加出彩！无论您是生信小白还是资深研究者，都能一键上手，快速生成专业级图片。快来一起探索体验吧！

一、高级相关性分析

1.应用场景

相关性分析能够展示样本内重复性和样本间的相关程度，是实验质控的重要指标。组内重复间相关性系数越大，组间样本相关性系数越小，表明实验效果越好。本工具适用于多个样本之间或蛋白（基因）之间的相关性分析，可选pearson、spearman、kendall等相关性系数计算方法，使用R语言进行可视化，通过颜色、形状和数值等方式直观展示变量之间的相关性。

2.输入数据

上传符合要求的数据文件，具体可参考示例文件格式。需要输入：蛋白/基因的表达矩阵文件+样本分组文件。若在景杰做过组学项目，可直接使用结题报告中文件2-Basic_analysis/MS_identified_information.txt、

2-Basic_analysis/repeat_list）

3.工具界面

绘图工具三段式分布：左侧参数按钮、中间图片展示与下载、右侧使用教程。

图注：【高级相关性分析】工具主界面

4.输出结果

绘图结果（png/pdf格式图片）、绘图数据、绘图主要参数可通过点击'结果下载'按钮一键下载。

绘图结果：png/pdf格式的相关性结果图片；

绘图数据：计算的相关性系数及显著性P值结果表格；

绘图参数：绘图过程中使用的参数及对应值，保留在表格中，方便查询及复现。

二、桑葚气泡图

1.应用场景

桑基气泡图用于展示关联数据的流动规律，在气泡图左侧引入桑基图，可直观呈现各通路所包含的基因；结合右侧气泡图，可同步观察通路的显著性水平。该图特别适用于多种组学数据，能够以多维方式揭示基因在不同通路间的关联结构、关键调控关系及其生物学意义。

2.输入数据

上传符合格式的自定义数据：文件所有列名无要求，可随意命名，列顺序无要求，可随意排布。文件至少含有必须的两列字符串列以及一列数值列，若存在其他数字列，可用于调节气泡图的样式，其他多余列不影响。

图注：输入文件格式

若在景杰做过组学项目，可直接输入项目标准分析富集结果6-Functional_enrichment文件夹下的富集数据（xlsx或txt）：

图注：可直接输入景杰组学项目富集结果

3.工具界面

图注：【桑基气泡图】工具主界面

4.输出结果

绘图结果（png/pdf格式图片）、绘图数据、绘图主要参数可通过点击'结果下载'按钮一键下载。

三、条形图

1.应用场景

本工具可绘制各类条形图：基础条形图、分组（簇状）条形图、堆积条形图、百分比堆积条形图，以及双向条形图（蝴蝶图）、分页面条形图、多种格式组合条形图。展示多个维度的数据。

常规条形图：展示不同类别之间的数值比较；

双向条形图：用正向和反向的条形图显示不同类别之间的数值比较；

分页面/双向分组/堆积条形图：增加更多维度的信息展示不同类别之间的数值比较。

图注：可绘制的各类条形图示例

2.输入数据

可自定义输入固定格式的数据文件：文件所有列名无要求，可随意命名，列顺序无要求，可随意排布。每行是一个功能通路或蛋白(可重复)，每列为一个特征或分类。必须列有：一列字符列用于纵轴，一列数值列用于横轴。默认第一行为列名，列名可包含空格、点，列名及数据列不允许出现#&等特殊字符。

图注：输入文件格式

3.工具界面

图注：【条形图】工具主界面

四、散点图

1.应用场景

散点图是一种用于直观探索两个变量之间关系的可视化方法。通过观察数据点的分布趋势，可以判断变量间是否存在正相关、负相关或无明显相关性。在相关性分析中，散点图常与趋势线（如线性回归线）结合使用，以更直观地展示变量之间的变化规律。本工具能够根据用户上传的不同数据类型，灵活生成多种形式的散点图，包括常规散点图、带分组信息的散点图、密度散点图、多组分面散点图以及带边际分布的散点图等。同时，用户还可以针对特定散点自定义标签大小、字体样式等，以突出关注的重点信息。

2.输入数据

上传符合格式的自定义数据：文件所有列名无要求，可随意命名，列顺序无要求，可随意排布。文件至少含有必须的两列数值列，默认第一行为列名，列名不允许出现中文字符；每一列不允许出现#&等特殊字符。

图注：输入文件格式

3.工具界面

图注：【散点图】工具主界面

五、GSEAVis--GSEA结果美化

1.应用场景

本工具用于对GSEA富集分析结果进行美化。可实现的功能包括：1.可循环输出所有显著单通路、输出感兴趣单通路、输出感兴趣多通路合并图片；2.标注目标通路中的感兴趣基因。

图注：显著富集单通路（左）；感兴趣多通路合并（右）

2.输入数据

可直接使用GSEA富集分析软件生成的结果压缩包或景杰云平台工具《GSEA富集分析》生成的结果压缩包。

3.工具界面

图注：【GSEAVis--GSEA结果美化】工具主界面

4.输出结果

成功运行后，将出现下载按钮和下载文件名修改框。若运行失败，将会弹窗提醒失败信息。点击结果下载按钮可一键导出结果压缩包，包括分析结果和运行参数。

六、icelogo

1.应用场景

探索发生修饰的氨基酸位点附近的序列规律对于了解引起这些修饰的潜在生物学过程是非常重要的，本工具可根据上传的矩阵文件数据和蛋白序列文件进行icelogo分析。

图注：修饰位点Motif特征 iceLogo图

2.输入数据

需要两个文件：

表达矩阵文件：数据至少包含三列信息，第一列：蛋白ID信息，第二列：修饰位点信息，第三列：氨基酸信息，不需要固定列名，但需要固定列顺序。若在景杰做过修饰组学项目，推荐直接使用项目报告中矩阵文件：2-Basic_analysis/MS_identified_information.txt

fasta序列文件，支持三种方式上传：本地文件上传、粘贴注释文件夹路径或手动选择注释文件夹路径。

3.工具界面

图注：【icelogo】工具主界面

4.输出结果

成功运行后，将出现下载按钮和下载文件名修改框。若运行失败，将会弹窗提醒失败信息。结果压缩包中，除了分析数据和图片外，还包含分析报告和结果说明文档，可对照查看。

七、序列处理

1.应用场景

生物信息学研究中，常常需要对核酸序列或氨基酸序列进行去重、提取、格式化等，以便后续的序列分析、功能注释或实验设计。本工具可以帮助用户完成常见的序列操作。

2.输入数据

支持手动上传fasta/fa格式的序列文件，也可以根据目录层级选择工具内置的序列文件。

3.工具界面

图注：【序列处理】工具主界面

4.输出结果

当分析完成且结果没有错误时，会出现下载结果的按钮，点击下载即可！

结果压缩包中包含：序列格式化文件、序列去重后文件、序列提取后文件、序列描述信息及序列统计信息等。

八、表格处理

1.应用场景

本工具对表格可进行如下处理：1.多表格合并、2.去重行列合并、3.长宽数据转换、4.查询与筛选、5.表格拆分。每个功能即可单独使用，也可串联执行。

多表格合并：支持行合并、列合并和关联合并（内连接、左连接、右连接、全连接）；

去重行列合并：①按指定列合并重复行，对其他列进行聚合计算（拼接、求和、平均值等）；②对所选列进行可选分隔符合并，合并成新列；

长宽数据转换：实现长格式数据和宽格式数据的相互转换；

查询与筛选：支持基于多列多条件的筛选，包括数值大小比较和字符匹配，可输入包含一列名字列表的文件，支持多条件AND/OR逻辑关系；

表格拆分：按行或按列拆分表格为多个子文件，可选：按行拆分-根据行数、按行拆分-根据某列内容、按列拆分-选定分组、按列拆分-选定匹配。

2.输入数据

可以上传任意的矩阵文件进行处理；文件格式兼容txt/xlsx/xls/csv四种，其中xlsx文件上传后可以选择特定的sheet子页进行分析。

3.工具界面

图注：【表格处理】工具主界面

4.注意事项

是否导入前页已有结果：排序靠前功能页面中已执行表格处理后，在后续功能页面内可选择使用之前页面内的结果，实现功能串联。

选择sheet数据进行处理：多表格合并时，上传xlsx时可多选sheet数据；其他表格处理，上传xlsx时只可选择一个sheet数据。

当分析完成且没有错误时，会出现下载结果的按钮，点击下载即可！

更多说明可直接查阅各工具内置使用教程，边学边用，方便快捷！本期就为大家介绍到这里，欢迎点击下方云平台链接操作体验！

如果您对景杰生信云平台感兴趣，想要了解更多信息，欢迎访问景杰生物云平台：https://ptm-biolab-css.com.cn/cloud/cloudTool，免费注册登录后即可畅享全部功能，祝大家可以通过景杰云获得更好的研究成果和使用体验！

作为蛋白质组学领域的科研工作者，我们会不断地进行更新优化，充分利用景杰云，持续提供更全面、更高效的技术支持与服务，提高广大用户的科研效率！更多好用工具持续上新中，敬请关注！

图注：景杰云现有工具分类清单

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#景杰生信分析

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