重磅上线|景杰生物 Hi-Plex CUT&Tag:一次实验,洞见多靶标表观调控全景
明星产品 PTMab科研抗体 曾悦 2026-08-14 17:21


在表观遗传研究中,很多关键问题并非只由“一个靶点”决定。

  • 增强子是否被激活?
  • 抑制性修饰是否解除?
  • 转录因子是否与组蛋白修饰协同调控?
  • 疾病、药物处理或细胞分化过程中,哪些表观调控组合真正发生了变化?

些问题,本质上都指向一个趋势:
表观研究,正在从单一靶标定位,走向多靶标组合模式解析。


传统CUT&Tag擅长高精度单靶标定位,可以帮助研究者回答“某一个靶点在哪里”。但当研究问题进一步涉及组蛋白修饰串扰、多因子共定位、转录因子-染色质协同调控时,单靶标检测往往需要多轮实验、分批建库,再通过后续peak overlap间接推测靶标间关系


这不仅增加样本消耗与实验周期,也难以在同一样本背景下直接解析多个靶标之间的组合关系。


为帮助研究者更高效地解析复杂表观调控网络,景杰生物正式推出新一代表观遗传多靶标检测技术。






Hi-Plex CUT&Tag —— 一次实验,同步解析3–30个表观靶标

Hi-Plex CUT&Tag,简称HCT,是一种面向多靶标表观遗传研究的新型CUT&Tag技术。该技术可在同一实验体系中同步检测多个染色质靶标,包括经典组蛋白修饰、新型组蛋白修饰、转录因子及转录调控因子等【1】

HCT不仅能够获得单靶标定位信息,还可以进一步解析不同靶标在基因组区域层面的共定位与组合关系。


从单靶点定位,到多靶标共定位解析;从“看到一个靶点”,到“读懂一套调控关系”。


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技术原理:从Homotone到Heterotone,解析真实共定位


在HCT体系中,不同靶标抗体经过特异性标记后,在同一样本中识别对应的染色质结合位点。随后,Tn5转座酶在靶标附近完成切割与接头插入,通过后续测序与生信解析,获得不同靶标的定位信号及靶标组合关系。

其中,HCT结果主要包括两类信息:
  • Homotone信号代表单个靶标自身的结合位点,可用于分析某一组蛋白修饰或转录因子的基因组分布。
  • Heterotone信号代表不同靶标之间的共定位关系,可用于解析多个修饰或调控蛋白是否在同一染色质区域协同出现。

图1 HomotoneHeterotone原理示意图
换言之,HCT不是简单地把多个CUT&Tag结果“叠加”在一起,而是在同一实验体系中直接捕捉多靶标之间的原位关联,为研究表观调控网络提供更接近真实状态的数据基础。

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技术流程:一次实验,多靶标同步完成


景杰生物Hi-Plex CUT&Tag整体流程包括:

  • 靶标Panel设计
根据研究方向选择目标靶标,可覆盖激活型修饰、抑制型修饰、新型酰化修饰、转录因子及染色质调控蛋白等。
  • 样本准备与质量评估
适用于细胞、组织等样本类型,尤其适合样本珍贵、难以多轮重复取样的研究场景。
  • 多靶标抗体预偶联与结合
多个靶标在同一反应体系中同步识别,保留同一样本内的真实染色质状态。
  • Tn5转座酶切割与文库构建
在靶标附近完成片段化和文库构建,获得可用于高通量测序的多靶标文库。
  • 测序与生信解析
输出单靶标peak、差异peak、靶标相关性、Heterotone共定位信息、基因组功能注释、IGV可视化及公共数据集对比等结果。
图2 Hi-Plex CUT&Tag技术流程【1】

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景杰内测多靶标项目数据展示


为验证HCT技术的稳定性、灵敏度与生物学解释能力,景杰生物开展了多轮内测项目。

景杰内测数据质量稳定,重复性与信噪比表现良好

景杰内测多靶标项目数据展示,各靶标不同重复间相关性良好,相关性系数可达95%以上;而不同靶标之间,激活型修饰(H3K27ac、H3K4me3与H3K27cr)与抑制性修饰(H3K27me3与H3K9me3)存在明显区分;各靶标peak数量充足,证明该技术高灵敏度;FRiP等关键质控指标表现稳定,说明HCT在多靶标体系下仍具备可靠的高信噪比数据输出能力。

图3 景杰生物内测多靶标数据样本相关性与信噪比展示

景杰内测多靶标数据与公共数据库结果趋势一致

景杰生物完成了十靶标HCT内测数据,靶标覆盖经典组蛋白修饰、新型酰化修饰及转录调控相关标志,包括:
H3K27cr、H3K27me3、H3K27ac、H3K4me3、H3K9me3、H3K4me1、H3K18la、H3K9la、H3K9ac、RNAPol2S2P等。 

为进一步验证HCT检测结果的可靠性,我们将十靶标HCT获得的homotone数据与ENCODE Reference Epigenome已有的公开ChIP-seq数据进行IGV track对比。

结果显示,多个经典组蛋白修饰的HCT信号与ENCODE公开数据在峰位点、信号强度及整体趋势上具有较好一致性,说明HCT在多靶标体系下仍可获得可靠的单靶标定位数据

4 景杰生物十靶标HCT homotone数据与ENCODE公共数据集IGV比对验证

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哪些课题适合优先考虑HCT?



判断一个课题是否适合Hi-Plex CUT&Tag,可以先看两个关键词:
多靶标共定位 + 明确分组对照
如果您的研究不只是想知道“某一个靶点在哪里”,而是想进一步回答:
  • 多个表观调控因子是否在同一区域共同出现?
  • 不同修饰之间是否存在协同、拮抗或状态转换?
  • 疾病、药物处理、细胞分化过程中,哪些靶标组合真正发生了变化?
那么,HCT就非常值得优先考虑。





1. 关注多种表观因子的协同 / 共定位调控
表观遗传调控并不是单个修饰的“独角戏”,很多关键调控状态往往由多个表观标记共同定义。
经典研究表明,抑制性修饰H3K27me3与激活性修饰H3K4me3可共同标记“二价染色质区域”,使谱系决定基因在相对沉默的状态下保持被激活的潜能,从而参与细胞命运决定与谱系分化调控【2】【3】。

类似地,增强子激活、启动子状态转换、异染色质形成、转录延伸和TAD边界维持等过程,也往往需要多个表观因子共同定义。

这也是HCT的核心应用价值之一:

从单一靶标定位,进一步走向多靶标组合模式解析。

常见的表观标记组合及其代表的调控区域包括:

2. 已有明确分组,并关注基因调控或细胞状态变化

如果研究中已经有明确分组样本,并且关注基因调控、细胞状态转换或表观修饰变化,也可以主动考虑HCT。

一个典型判断标准是:

对照越清楚,靶点越成熟,样本越难得,多靶标HCT越有价值。

HCT可适用于多种表观遗传研究场景,包括:
  • 临床 / 肿瘤研究
    适合诊断与复发、治疗前后、预后分层、药物敏感与耐药等研究。
  • 发育 / 细胞命运研究
    适合干细胞分化、发育时序、模型扰动和细胞命运转换研究。
  • 免疫 / 代谢 / 药物研究
    适合炎症刺激、感染模型、代谢环境变化、衰老和候选药物筛选。
  • 植物 / 农业研究
    适合昼夜节律、逆境胁迫、育种性状和病原互作研究。

景杰生物HCT正式上线

景杰生Hi-Plex CUT&Tag现已正式上线,可提供从靶标Panel设计、样本方案评估、实验检测生信分析解读的一站式服务。作为景杰生物表观遗传技术布局中的重要新产品,HCT不仅是传统CUT&Tag在检测通量上的升级,更是蛋白组学后机制研究的重要承接工具。

后续,我们也将以系列推文的形式,持续为大家介绍:

  • HCT如何解析组蛋白修饰串扰与二价染色质状态

  • HCT如何助力顺式调控元件的研究

  • HCT如何应用于新型组蛋白修饰研究

  • HCT Panel如何设计

欢迎持续关注景杰生物,和我们一起追踪Hi-Plex CUT&Tag技术动态。


立即咨询,获取景杰生物HCT定制化方案

景杰生物Hi-Plex CUT&Tag已正式上线,可提供从靶标Panel设计、样本方案评估、实验检测到生信深度解析的一站式服务。

欢迎扫码咨询,获取HCT技术材料,若您有进一步的课题设计或技术支持需求,欢迎拨打400-100-1145。

参考文献:
【1】Liao et al.bioRxiv2025.
2Bernstein et al., Cell, 2006; PMID:16630819.
3Zhou et al.Cell, 2025; PMID:40774253.



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