全景洞察 | Spatial X全息蛋白组突破视野局限，重绘时空蛋白新地图

景杰生物 | 报道

空间蛋白质组学正在以前所未有的精度重塑生命科学研究范式。作为2024年度技术（Nature Methods），这项技术突破了传统蛋白质组学"均质化"分析的局限，在保留组织空间位置信息的同时，实现蛋白表达的精准定量。然而，现有技术常陷入"看得见区域、测不到深度"的瓶颈——空间分辨率、蛋白覆盖度与翻译后修饰位点鉴定三者难以兼得，成为制约临床转化的关键卡点。

景杰生物作为空间蛋白质组学领域的先驱与引领者，基于创新性10X Proteomics平台、LCM激光捕获显微切割和AI技术，持续推动技术革新。已重磅推出Spatial X全息蛋白/磷酸化组学，真正实现全组织层面的蛋白质表达可视化，达成"厘米级空间覆盖，微米级精准切割，修饰组独家解码"的技术突破，精准绘制驱动耐药、复发及疾病进展的蛋白修饰"全景地图"，为精准医学研究提供全方位的空间蛋白解决方案。

图1 Spatial X解析组织蛋白质/磷酸化修饰全景分布

本文为大家总结了Spatial X全息蛋白/磷酸化修饰组学突破的5大应用场景：肿瘤微生态、心血管疾病、神经领域疾病、生殖发育、图谱全景解析，并整理了一些高分案例和高水平代表性成果，希望为大家的科学研究提供新的思路和灵感。

深度解析肿瘤微生态空间分布

肿瘤研究的突破往往依赖于对“空间异质性”的精准解析。 Spatial X凭借厘米级覆盖与微米级切割的核心优势，完美适配肿瘤研究的核心需求，聚焦肿瘤异质性、耐药机制、复发预测等关键研究方向，精准捕捉肿瘤不同区域的蛋白表达差异，绘制肿瘤微环境全景图谱。

Nat Genet | 空间蛋白组揭示肿瘤不同免疫微环境区域空间分子特征差异（合作文章）

文章标题：Multiomic analysis of cervical squamous cell carcinoma identifies cellular ecosystems with biological and clinical relevance

发表期刊：Nature Genetics（IF=29.0）

概述：细胞异质性和可塑性是肿瘤进展和肿瘤免疫微环境调节的基础，对这些细胞状态的形成和可塑性等调控机制的研究有助于宫颈癌免疫治疗的理解。华中科技大学同济医学院附属同济医院基于多种空间组学（与景杰生物合作空间蛋白质组学），利用LCM技术区分了肿瘤免疫区域，系统地描绘了CSCC肿瘤的高分辨空间图谱。探索了CSCC的肿瘤异质性，为其他鳞状恶性肿瘤的研究提供了基础。同时，揭示了CSCC中MP6状态肿瘤通过FABP5介导的TGFβ信号通路重塑免疫微环境并逃避免疫的机制，为宫颈癌和鳞状细胞癌的免疫联合治疗提供了潜在靶点和依据。

全文解读链接：首篇宫颈鳞癌整合空间组学分析揭示肿瘤免疫微环境景观

动态管理心血管疾病机制

基于心脏组织独特且清晰的空间构象，Spatial X全息蛋白/修饰组学可直接揭示动脉斑块、心肌病灶等内部不同区域的蛋白质组差异，原位描绘心肌细胞、免疫细胞、成纤维细胞等之间的通讯网络与空间关系，将特定的分子异常与具体的病理表型在组织原位直接关联，为机制研究与靶点发现提供空间证据。

Eur. Heart J | 空间蛋白组解析心脏结节病诊断新契机与微环境异质性

文章标题：Cardiac sarcoidosis: new insights beyond the granuloma using spatial proteomics

发表期刊：European Heart Journal（IF=35.8）

概述：该研究是不同心脏细胞区域取样经典案例，在64例心脏结节病组织FFPE样本中重点选取了不同距离的非肉芽肿实质区域，包括：肉芽肿区、肉芽肿周围区（距离肉芽肿<300 µm）、肉芽肿远隔区（距离肉芽肿 >500 µm）。该研究通过基于空间蛋白组学，首次在缺乏肉芽肿的心肌组织中发现了特异性的免疫特征，构建的7蛋白预测模型，在无炎症区域识别CS的准确率高达95.9%。

创新解析神经系统疾病

对于神经系统疾病，脑区功能特异的蛋白图谱、神经退行性病变的早期空间标志物、血脑屏障相关的空间维度的蛋白调控逻辑贯穿生命全过程，Spatial X全息蛋白/修饰组学将脑组织的全部蛋白分子调控信息一图呈上，成为神经性疾病研究利器。

Nat Neurosci | 空间蛋白组揭示慢性神经退行性疾病关键靶点

文章标题：Identification of early neurodegenerative pathway in progressive multiple sclerosis

发表期刊：Nature Neuroscience（IF=20.0）

概述：进行性多发性硬化症 (MS) 表现出持续的神经退行性变，导致累积性残疾并且对目前的治疗无效。本研究对新鲜冷冻的人类MS脑组织使用空间转录组学和蛋白质组学确定了进行性MS发病机制的多细胞机制，并追踪其与神经退行性变的空间分布阶段相关的起源。该研究结果为药物开发策略提供了一个新的框架，为促进MS的复杂细胞和信号动力学的理解提供了重要的基础。

全文解读链接：Nat Neurosci | 多发性硬化症早期发病机制

全面解析生殖发育奥秘

生命的起点蕴含着最精密的空间调控逻辑。Spatial X全息蛋白/修饰组直接揭示蛋白质在组织中的精确分布，定位信号中心、生殖嵴等关键区域，并将异常的蛋白质表达模式与具体的形态缺陷在空间上直接关联，定位发育障碍或生殖疾病的分子起源。

Cell Stem Cell | 空间蛋白组揭示慢性神经退行性疾病关键靶点（合作文章）

文章标题：3D post-implantation co-culture of human embryo and endometrium

发表期刊：Cell Stem Cell（IF=20.4）

概述：人类胚胎的成功着床及早期发育，高度依赖胚胎与母体子宫内膜之间精确的时空对话与分子互作。该研究成功构建了首个支持人类胚胎与子宫内膜类器官三维共培养的着床后模型，可支持胚胎发育至受精后14天。研究首次在体外观察到子宫内膜微环境可加速绒毛外滋养层（EVT）的早期出现和功能成熟，并基于空间蛋白质组学技术系统解析了胚胎-子宫内膜界面的分子互作网络。其中hCG-LHCGR通是胚胎粘附和早期发育的关键调控因子，为揭示母胎间配体-受体通讯通路提供了关键理论支撑。

全文解读链接：Cell Stem Cell | 空间蛋白组揭示人胚胎-子宫内膜分子通讯网络

物种图谱的核心价值分析

全面解析物种图谱有助于了解生命动态变化与差异。多物种的组织器官区域大小，完美适配Spatial X全息蛋白/修饰组标品大小，微米级的分辨率和数千种蛋白质/磷酸化位点的深度覆盖，揭示蛋白构成及通路激活状态。

Nat Commun | 时空蛋白质组学揭示猕猴大脑发育图谱研究（合作文章）
文章标题：Spatiotemporal proteomic atlas of multiple brain regions across early fetal to neonatal stages in cynomolgus monkey

发表期刊：Nature Communications（IF=15.7）

概述：中枢神经系统的发育需要经历十分复杂的变化，结合大规模组学技术绘制人类与非人类灵长类动物大脑特定区域的分子图谱，为理解大脑的生物网络、通路和动态变化提供有价值的参考。该研究对四个发育阶段的12只猕猴大脑精准采样，共获得156个不同大脑区域的脑组织进行空间蛋白质组学，系统分析了非人类的灵长类动物从胎儿到新生儿发育阶段的多个大脑区域的全面的时空蛋白质组特征，有利于了解正常发育过程中大脑功能以及人类功能障碍和疾病的机制，并将对神经科学研究具有深远的影响。

全文解读链接：时空蛋白质组学揭示猕猴大脑发育图谱研究

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