五大样本类型全解读！2025体液蛋白质组学高影响力研究精析

景杰生物 | 报道

体液（如血液、尿液、脑脊液等），是窥探人体健康与疾病状态的“动态窗口”，其中蕴含的丰富蛋白质信息，能直接反映生理过程的细微变化与病理状态的深层特征。随着蛋白质组学技术的突破，我们已能深度解码这些体液中的分子图景，从而揭示疾病机制、发现新型标志物、推动精准医疗的发展。从疾病的早期诊断到疾病进展的监测，从代谢调控到感染判别，体液蛋白组学正成为连接科研与临床的关键桥梁。

此前，我们回顾了2025年具有代表性的16篇乳酰化修饰研究成果及16篇非乳酰化的新型酰化修饰案例。

本次盘点我们将继续聚焦2025年体液蛋白组领域发表的重磅成果，从中精选15篇典型案例，涵盖血液、外泌体、尿液、脑脊液等多样本类型，涉及肿瘤、衰老、感染和神经等多领域，希望为您的研究带来更多启发。

血液篇

血液作为医学研究和临床诊断中最常见的体液样本，是反映人类健康和疾病状态的理想生物标本，蕴含着丰富的生物分子，包括蛋白质、代谢物、多肽等，这些分子能够指征疾病的发生和进展，是疾病早期诊断和预后的重要生物标志物。

01 Nature | 中山大学张常华等团队血浆蛋白组揭示胰腺癌细胞命运调控机制

文章题目：SPP1 is required for maintaining mesenchymal cell fate in pancreatic cancer

研究概述：胰腺导管腺癌间质细胞对疾病进展至关重要，但其自身命运的调控机制尚未明确。该研究通过血浆蛋白质组学筛选出关键调控因子SPP1，其在晚期PDAC患者中显著上调，并结合转录组学等实验，首次揭示了分泌蛋白SPP1通过CD61受体激活NF-κB-BMP2–GREM1信号轴，形成上皮-间质细胞双向调控环路，精确控制PDAC上皮与间充质细胞命运决定的新机制。景杰生物为该研究提供了基于磁球的10X高深度血浆蛋白组技术支持（产品：10X Blood+DIA蛋白组）。

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图研究模式图

02 Cell | 复旦大学樊嘉院士团队血浆蛋白组揭示肿瘤跨器官神经免疫逃逸新机制

文章题目：Cancer cells co-opt an inter-organ neuroimmune circuit to escape immune surveillance

研究概述：癌症是否以及如何利用远隔器官逃避免疫监视在很大程度上尚不清楚。研究通过血浆蛋白质组学、CUT&Tag等技术，首次揭示了一种由癌细胞驱动的“肿瘤-引流淋巴结（TDLN）”跨器官神经免疫调控回路：癌细胞在免疫压力下经ATF4-SLIT2轴激活痛觉神经元，后者通过分泌CGRP重塑TDLN为免疫抑制状态，减少CCL5分泌，最终促进TAM M2型极化，推动肿瘤进展并削弱ICB疗效。该发现为癌症免疫逃逸提供了新视角，也为联合靶向痛觉神经元与ICB治疗提供了临床转化依据。

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图研究模式图

03 Cell | 中科院动物所刘光慧等团队：多组学图谱揭示运动抗衰新机制

文章题目：Systematic profiling reveals betaine as an exercise mimetic for geroprotection

研究概述：运动如何在分子层面上重塑人体稳态和免疫功能，延缓衰老进程，尚不完全清楚。该研究通过血浆蛋白质组学等多组学方法，对13名健康男性志愿者在不同类型运动前后的血液和粪便样本进行分析，揭示了急性单次运动和长期规律运动在分子层面、免疫、代谢和微生物稳态等方面的动态变化图谱，并发现甜菜碱可能是运动发挥抗衰老作用的关键分子。为开发基于运动的抗衰老干预措施提供了新的靶点。景杰生物为该研究提供了血浆蛋白组技术支持（产品：Blood+DIA蛋白组）。

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图研究模式图

04 Cell | 29种器官+细胞蛋白组图谱，解密人类血浆蛋白起源之谜

文章题目：Human proteome distribution atlas for tissue-specific plasma proteome dynamics

研究概述：目前对各器官和细胞在健康与疾病状态下如何影响血浆蛋白质组仍缺乏系统研究。该研究基于质谱的蛋白质组学方法，首次构建了包含21种组织、8类血细胞的人类蛋白质组分布图谱，实现了血浆中蛋白质的组织起源的准确推断，并揭示了这些蛋白质在疾病状态下的动态变化。研究成果为解析血浆蛋白质组的组织来源和疾病动态变化提供了全新视角。

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图研究模式图

05 Nat Genet | Mann团队新作：大队列血液蛋白组打开儿童健康成长密码

文章题目：Plasma proteome variation and its genetic determinants in children and adolescents

研究概述：儿童肥胖对于了解其健康影响以及制定有效的预防和治疗策略至关重要。该研究通过基于质谱的血液蛋白组学对大队列儿童和青少年的血浆样本展开分析，深入探讨了遗传变异、年龄、性别和体重指数（BMI）对血浆蛋白组的影响，发现58%的血浆蛋白水平与这些因素相关，并识别了1252个主要的蛋白质数量性状位点（pQTLs），影响327种蛋白质的水平，突显了遗传因素在调节血浆蛋白水平中的重要作用，为生物标志物研究和疾病预防策略提供了重要参考。

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06 Nat Commun | 血液N-糖基化揭示新冠Omicron变异株致病新机制

文章题目：VCL/ICAM-1 pathway is associated with lung inflammatory damage in SARS-CoV-2 Omicron infection

研究概述：目前，对于新冠Omicron变异株导致血管屏障破坏的机制知之甚少。该研究综合运用血浆蛋白质组学、N-糖基化修饰组学等方法，系统性地揭示了SARS-CoV-2 Omicron变异株和原始毒株感染导致肺部炎症损伤的分子机制，特别是VCL/ICAM-1通路及其N-糖基化修饰的关键作用。其中，VCL通路是Omicron感染的标志性特征，且VCL和ICAM-1的N-糖基化水平呈相反趋势。此外，靶向VCL可减轻肺部渗出和改善屏障损伤。为开发针对性的治疗策略提供了理论依据。景杰生物为该研究提供了血浆蛋白质组学、蛋白质N-糖基化修饰组学和代谢组学技术支持。

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图研究模式图

外泌体篇

最新研究表明，外泌体（如细胞外囊泡）形成了一种特殊的细胞间信息传递系统，它不仅影响细胞的生理状态，而且还与多种疾病的发生与发展密切相关。外泌体领域的研究已经在癌症的诊断及治疗等领域发挥重要作用，基于质谱的高通量蛋白质组学是研究外泌体不可或缺的一项技术手段。

01 Cell | 外泌体蛋白组+MHC免疫多肽组首次揭示黑色素瘤免疫逃逸新机制

文章题目：HLA export by melanoma cells decoys cytotoxic T cells to promote immune evasion

研究概述：黑色素瘤作为最具致命性的皮肤癌，半数患者对免疫治疗响应有限，提示可能存在尚未被完全揭示的免疫逃逸新机制。该研究首次发现黑色素瘤特异性的大型囊泡——黑色素体通过表面携带的MHC-肿瘤抗原复合物直接结合CD8+ T细胞受体（TCR），竞争性抑制T细胞对肿瘤的识别，并诱导T细胞功能障碍和凋亡，提出了一种全新的免疫逃逸机制。

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图研究模式图

02 Cell Metab | 南大毕艳/李靓：外泌体蛋白组揭示细胞外囊泡调控肥胖机制

文章题目：Adipocyte-derived extracellular vesicles are key regulators of central leptin sensitivity and energy homeostasis

研究概述：本研究证实脂肪细胞来源的细胞外囊泡（Ad-EVs）作为关键信使，通过其携带的miRNA调控中枢瘦素敏感性以维持能量稳态。通过外泌体蛋白质组学，研究锁定了可介导Ad-EVs中枢靶向的关键膜蛋白SIRPα和MCAM。据此开发的工程化外泌体可高效递送瘦素增敏型miRNAs至中枢，成功逆转瘦素抵抗并减轻肥胖。该研究不仅揭示了脂肪-脑轴调控能量稳态的新机制，也为肥胖治疗提供了新的潜在策略和方法。景杰生物为该研究提供了外泌体蛋白质组学技术支持。

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图研究模式图

03 Cell Metab | 中山大学林东昕/郑健：外泌体蛋白组揭示脂肪里隐藏的肿瘤免疫“刹车”

文章题目：Extracellular vesicles from obese visceral adipose promote pancreatic cancer development and resistance to immune checkpoint blockade therapy

研究概述：该研究首先发现肥胖内脏脂肪来源的细胞外囊泡（VAT-EVs）可介导脂肪-肿瘤通讯，进而促进胰腺癌生长。进一步通过蛋白质组学和外泌体蛋白质组学，锁定到VAT-EVs携带的组织蛋白酶A（CTSA）是驱动癌症进展的关键因子。机制上，CTSA稳定核糖核酸酶RNASET2，进而产生游离的假尿苷，最终激活肿瘤微环境中的肥大细胞、形成免疫抑制微环境，从而驱动胰腺癌进展并导致ICB治疗抵抗。为临床上逆转肥胖相关PDAC的ICB耐药提供了可行的联合治疗策略。景杰生物为该研究提供了蛋白质组学与外泌体蛋白质组学技术支持。

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图研究模式图

尿液篇

现有组织学生物标志物存在侵入性强、时空异质性高、无法动态反映肿瘤微环境变化等局限。尿液作为一种无创、可重复获取的样本来源，其蛋白质组可反映全身生理状态及肿瘤微环境动态，近年来在肿瘤生物标志物等研究中展现出巨大潜力。

01 Gut | 北京协和医院赵海涛团队尿液蛋白质组揭示胆道癌免疫治疗标志物

文章题目：Dynamic urinary proteomics integrates single-cell and spatial transcriptomics to reveal tumour microenvironment and predict immunotherapy response in biliary tract cancer

研究概述：目前缺乏能够动态监测肿瘤微环境(TME)变化和预测免疫治疗响应的生物标志物。该研究基于211例尿液样本，采用尿液蛋白质组学与平行反应监测（PRM）质谱技术，系统分析了胆道癌患者接受免疫检查点抑制剂（ICIs）治疗前后的尿液蛋白质组动态变化，阐明了尿液蛋白质组与肿瘤微环境的关联。其中深入揭示了PTPN13作为关键调控因子在塑造促凋亡肿瘤微环境、增强免疫治疗响应中的机制。此外，研究构建的包含4个尿液蛋白（PTPN13、SUB1、MICAL-L1、VARS1）的机器学习预测模型，为临床实现个体化免疫治疗提供了可行的无创解决方案，具有重要的转化医学价值。

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图研究模式图

02 Nat Commun|大队列尿液蛋白组揭示前列腺癌早诊标志物

文章标题：Prostate cancer reshapes the secreted and extracellular vesicle urinary proteomes

研究概要：该研究利用尿液蛋白质组学技术对190名男性的尿液样本进行了深度分析，揭示了尿液中分泌蛋白和EV蛋白的来源、特征及其在前列腺癌诊断中的应用潜力。其中尿液外泌体蛋白组是前列腺组织蛋白组的可靠标志物，为前列腺癌的无创诊断提供了新的方向。研究还发现尿液蛋白质组具有显著的时间稳定性，且在前列腺癌诊断与危险分层中具有良好的效果，展现了尿液蛋白生物标志物的开发潜力。为开发精准、非侵入性的前列腺癌诊断方法提供了理论依据。

全文解读链接：标志物研究新突破！Nat Commun|大队列尿液蛋白组揭示前列腺癌早诊标志物

图基于尿液蛋白构建前列腺癌诊断模型

脑脊液篇

脑脊液作为中枢神经系统的“液态窗口”，能直接反映脑组织微环境与病理状态。由于血脑屏障的存在，脑脊液中的生物分子（尤其是蛋白质）能更特异地指示神经系统的生理与疾病过程，具有高临床相关性、动态性和来源特异性。因此，脑脊液蛋白质组研究是揭示神经疾病机制、发现生物标志物与药物靶点的关键桥梁，对推动神经疾病的精准诊疗至关重要。

01 Sci Transl Med | 脑脊液解码病理特异性的早期标志物

文章题目：Proteomic analysis reveals distinct cerebrospinal fluid signatures across genetic frontotemporal dementia subtypes

研究概要：额颞叶痴呆（FTD）是一种常见的早发性痴呆，目前缺乏能够区分不同病理类型的特异性生物标志物。研究采用蛋白质组学技术对来自遗传性额颞叶痴呆队列的238份脑脊液样本进行了深度分析，揭示了无症状和有症状的C9orf72、GRN及MAPT基因突变携带者中，脑脊液蛋白质组具有病理特异性的早期分子变化，并基于共表达网络构建了能够预测认知衰退的预后模型，为开发早期精准诊断和靶向干预策略提供了重要依据。

图研究模式图

02 Alzheimer’s Dement | 脑脊液蛋白质组揭示APOE基因型在阿尔茨海默病中的保护与风险机制

文章题目：Cerebrospinal fluid proteomic associations of APOE genotypes reveal distinct protective and risk mechanisms for Alzheimer's disease

研究概要：研究对569份脑脊液样本进行蛋白质组学分析，揭示了APOE ε2与ε4基因型在阿尔茨海默病早期阶段具有相反作用的分子机制：ε2可能通过提升与神经元可塑性相关的蛋白质表达和维持血脑屏障完整性发挥保护作用，而ε4则与血脑屏障功能障碍及葡萄糖代谢异常等风险机制相关，为理解遗传风险如何影响AD病理进程及开发针对性干预策略提供了重要依据。

图脑脊液蛋白水平表达情况

03 J Adv Res | 浙大团队：脑脊液蛋白质组揭示iNPH分流手术疗效预测标志物

文章题目：Proteomic profiling in cerebrospinal fluid reveal biomarkers for shunt outcome in idiopathic normal-pressure hydrocephalus

研究概要：研究通过对特发性正常压力脑积水（iNPH）患者脑脊液进行蛋白质组学分析，发现其蛋白质表达谱呈现神经炎症、细胞外基质重塑及神经退行性变特征。进一步借助机器学习，筛选出能预测脑脊液分流手术反应的生物标志物，并证实术后部分病理蛋白表达可逆。该研究为阐释iNPH病理机制及实现手术疗效预测提供了新依据。

图研究模式图

多体液组合篇

多体液研究打破了单一信息源的局限，通过“空间定位、时间追溯、交叉验证”的策略，为理解复杂疾病的全身性与局部性互动、发现高价值的生物标志物以及推动精准医疗提供了无可比拟的系统性视角和强大工具。

Nat Commun | 脑脊液与血浆蛋白质组学揭示莱姆病神经疏螺旋体病诊断标志物

文章题目：The diagnostic potential of proteomics and machine learning in Lyme neuroborreliosis

研究概要：本研究通过对莱姆病神经疏螺旋体病（LNB）患者的脑脊液与血浆样本进行蛋白质组学分析，并结合机器学习方法，系统揭示了LNB特异的宿主应答蛋白质特征。研究构建的诊断模型能有效区分LNB与病毒性脑膜炎及对照组，在脑脊液和血浆中分别达到高区分效能，为LNB的早期诊断、无创监测及治疗反应评估提供了新的潜在生物标志物与策略依据。