小编按语
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你是否曾经默默蹲在小黑屋等待Western blot奇迹的发生,可是说好的奇迹呢!苍天啊,大地啊,请赐我一个五雷轰顶吧,毕业无望啊!
当当当当~~~小编横空出世,为您提供完美解决方案,是不是有点小激动!!!
困扰一电泳中的问题
凝胶不均匀冷却,中间冷却不好;电泳系统温度偏高。
可能是由于装置不合适,特别可能是凝胶和玻璃挡板底部有气泡,或者两边聚合不完全。
样品溶解不好。
样品中含有不溶性颗粒。
电极不平衡或者加样位置偏斜。
加样量过多。
困扰二Western blot背景高且不均匀
一抗或二抗浓度太高会导致高背景,降低抗体浓度。
对比不同的封闭缓冲液。
非特异性位点封闭不足
1. 优化封闭缓冲液,最好的封闭缓冲液具有系统依赖性;
2. 提高封闭液中蛋白的浓度;
3. 在封闭液中加入Tween-20,Tween-20的终浓度为0.05%。
封闭液中与其它蛋白发生抗体交叉反应
1. 换一种不同的封闭液;
2. 不要用含抗生素蛋白的牛奶封闭,牛奶含生物素。
1. 保证膜完全被液体覆盖,避免其干燥;
2. 在孵育过程中始终进行震荡;
3. 小心夹膜——损坏膜可能导致非特异性结合。
缓冲液污染或结块沉淀
配置新的缓冲液。
若一抗和/或二抗浓度过高会产生高背景,降低抗体浓度。
困扰三Western blot信号弱或无信号
1. 转膜结束后,用总蛋白染色剂染胶来确定转膜效率;(注:总蛋白染色剂可能检测不到低量的抗原)
2. 确保转膜过程中胶与膜完全接触;
3. 确保转印夹层排布正确;
4. 确保按照膜的制造商的使用说明润湿膜;
5. 确保转印部件在电印迹过程中未过热;
6. 使用正对照和/或分子量Marker;
7. 优化转印时间和电流;
8. 确保样品制备条件优于蛋白印迹,为破坏样品的抗原性。 (注意:许多蛋白不能在还原状态下进行)
蛋白未完全结合到膜上
在转膜缓冲液中加入20%的甲醇促进结合。低分子量的抗原可能会穿过转印膜,需使用小孔径的膜进行。
增加抗体浓度。抗体与目标蛋白的亲和力可能很小;
抗体可能失活,可用斑点印迹检测其活性。
使用太多一抗或二抗可能导致信号迅速消失,呈现出很弱的信号。
1. 加入更多的蛋白进行跑胶;
2. 抗原被封闭液掩蔽;
3. 试用不同的封闭液;
4. 优化封闭液中蛋白浓度。
缓冲液中含有叠氮钠
叠氮钠是一种HRP的抑制剂,缓冲液不能使用叠氮钠作为防腐剂。
延长胶片的曝光时间(注意:超感应化学发光底物会持续发光至少6个小时)。
在使用超感应底物时需进行5分钟的底物孵育。
1. 超感应化学发光底物和超感应west膜室温状态下化学底物可保存至少12个月,超感应免疫膜化学发光底物可保存至少6个月;
2. 为衡量底物的活性,准备一个小量的工作液在一个暗室内,加入少量的HRP结合物,会观察到绿光。如果未检测到光,底物或HRP结合物均有可能失活;
3. 确保两底物无交叉污染两种底物试剂的污染可能导致活性下降。
封闭底物可能含有蛋白水解酶活性(如明胶)。
印迹膜保存时蛋白降解
准备一张新的印迹膜。
困扰四Western blot杂带较多
目的蛋白有多个修饰位点,本身可以呈现多条带
查阅文献或进行生物信息学分析,获得蛋白序列的修饰位点信,通过去修饰确定蛋白实际大小。
目的蛋白有其他剪切本
查阅文献或生物信息学分析可能性。
样品处理过程中目的蛋白降解
加入蛋白酶抑制剂;样本处理时在冰上操作。
上样量过多
适当减少上样量。
一抗不纯
纯化抗体。
困扰五Western blot无信号或显示信号弱
检测样本不表达目的蛋白
择表达量高的细胞作为阳性对照,用于确定检测样本是否为阴性。
检测样本低表达目的蛋白
提高上样量,裂解液中注意加入蛋白酶抑制剂。
转移不完全或过转移
可以用丽春红染膜并结合染胶(考马斯亮蓝)后确定条带是否转至膜上或转移过头;适当调整转膜的时间和电流。
抗体不能识别测试种属的目的蛋白
购买抗体前应当认真阅读抗体说明书,确定其是否能够交叉识别测试种属的对应蛋白。
一抗孵育时间不足
建议4℃结合过夜。
二抗与一抗不匹配
选择针对一抗来源的种属的抗体。
洗膜过度
洗膜时间不宜过长,加入的去垢剂不宜过强或过多,建议使用0.1%的弱去垢剂Tween-20。
困扰六其它现象
膜上多处出现黑点或黑斑
抗体与封闭试剂发生非特异性的结合。
反白(条带显白色)
目的蛋白含量太高或者一抗浓度偏高。
蛋白分子量偏低或偏高
胶浓度不适合,高分子量要用低浓度胶;小分子蛋白要用高浓度胶。
景杰生物(PTM Biolabs)凭借其强大的研发实力,开发了世界上种类最多、覆盖位点最全的蛋白质修饰泛抗体与组蛋白表观遗传标记抗体。景杰生物不仅提供常见的磷酸化(phosphorylation)、乙酰化(acetylation)、甲基化(methylation)、泛素化(ubiquitination)等修饰类型抗体,而且开发出O-乙酰氨基葡萄糖化(O-GlcNAc)、赖氨酸琥珀酰化(succinylation)、巴豆酰(crotonylation)、丙酰化(propionylation) 等新修饰类型抗体。

邹文安