书接上文
酰化修饰之间的crosstalk现象是不是普遍存在于生物体体内,浙江理工大学研究者决定将该项研究延伸到导致人类遭受海鲜传染疾病的元凶——副溶血性弧菌上,结果研究者在深入研究乙酰化的基础上,又一次将琥珀酰化与乙酰化crosstalk现象发表在Journal of Proteome Research上,又一次毫无争议的“横屏”了~~~
在本研究中研究者运用了高灵敏度抗体亲和富集技术并基于质谱的高准确度蛋白质组学分析技术鉴定副溶血性弧菌中乙酰化水平和琥珀酰化水平。实验得到了以下结果:
Figure 1. Overlap between lysine succinylation and lysineacetylation in V. parahaemolytisus.
共鉴定到656个乙酰化蛋白,1413个乙酰化位点;642个琥珀酰化蛋白,1931个琥珀酰化位点,乙酰化及琥珀酰化蛋白占副溶血性弧菌总蛋白质数量的13%以上;
通过生物信息学分析发现,副溶血性弧菌的乙酰化蛋白质参与多种细胞功能及存在于不同的亚细胞定位中,具体来说乙酰化蛋白质与蛋白质生物合成和碳代谢有着千丝万缕的联系;
琥珀酰化蛋白参与几乎所有的细胞过程,特别是在蛋白质生物合成和代谢中,并且分布在不同的亚细胞中;
更重要的是研究者发现超过288个蛋白质(44.9%)上的517个赖氨酸琥珀酰化位点(26.7%),同时发现存在乙酰化修饰,该结果表明在副溶血性弧菌这两种酰化修饰存在很强的crosstalk现象。
Figure 2. Overlap between succinylation and acetylation inproteins involved in the ribosome (A) and central metabolism (B).
总之,该研究提供了前所未有的副溶血性弧菌乙酰化及琥珀酰化的数据库,作为大数据时代下的宝藏,后续研究者可以进一步挖掘关于酰化修饰数据,从而反向指导实验设计,进一步发现琥珀酰化未来的高峰!
说了这么多琥珀酰化修饰学术方面的进展,很多老师会问如何才能预测自己研究的物种和琥珀酰化的关系呢?
写到这里我们的专题告一段落,小编有万般不舍,但是我们相信琥珀酰化作为善于“抢头条”的积极分子,一定会在未来为我们带来更多惊喜~~~~
本篇参考文献:
Pan J, et al. (2014) Systematic analysis of the lysineacetylome in Vibrio parahemolyticus. J Proteome Res. 13(7): 3294-302.
Pan J, et al. (2015) GlobalAnalysis of Protein Lysine Succinylation Profiles and Their Overlap with LysineAcetylation in the Marine Bacterium Vibrio parahemolyticus. J Proteome Res.14(10): 4309-18.
景杰生物(PTM Biolabs)凭借其强大的研发实力,提供独家开发的高灵敏度赖氨酸琥珀酰化抗体(PTM-401/PTM-402/PTM-419)及基于高等级质谱仪的高通量泛素化蛋白质组学技术服务,有效的推动泛素化研究进展。此外,景杰生物还提供全球最多种类的蛋白质修饰组学技术服务,包括赖氨酸乙酰化 (acetylation)、甲基化 (methylation)、泛素化 (ubiquitination)、磷酸化 (phosphorylation)、O-乙酰氨基葡萄糖化 (O-GluNAc)、巴豆酰化 (crotonylation)、丙酰化(propionylation) 等。
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邹文安