景杰生物/整理
二代测序技术的发展和成熟为人们提供了探究肿瘤机制的有力武器。然而,尽管针对不同肿瘤的基因和转录测序研究论文浩如烟海,然而真正对临床有实际指导意义的成果确是凤毛麟角。究其原因,在于肿瘤是由先天和后天因素相互交织引起的复杂疾病,许多肿瘤患者缺乏明确的“Driver Mutation”,单纯的基因组和转录组信息不足以反映肿瘤发生发展的全貌。
蛋白质作为功能的最终执行者,其差异变化是导致肿瘤发生的直接原因。运用蛋白质组学技术,通过对基因、蛋白质等遗传信息多维度、综合关联的分析,不但可以从蛋白质层面验证肿瘤相关的基因突变、可变剪切的真实表达情况,还能够直接检测蛋白表达丰度及翻译后修饰水平的差异,发现上下游调控分子,从而实现肿瘤的分子分型与精准治疗。
蛋白质组学是肿瘤精准医学发展的核心“驱动力”
Nature Biotechnology volume32, pages752–753 (2014)
标记物筛选与鉴定
Hepatology:鉴定血清外泌体中与胆管癌相关的蛋白生物标志物
“细胞之外”---利用蛋白质组学鉴定肺癌转移与预后的生物标志物
“再下一城”---利用蛋白基因组学揭示淋巴瘤的生物标志物和潜在药物靶点
NAT COMMU:磷酸化组学揭示三阴性乳腺癌临床分类标记物
似曾相识燕归来--蛋白质组学研究鉴定神经退行性疾病的蛋白标记物
疾病机理研究
文献解读| 蛋白质组学揭示阿尔茨海默症APs在人和小鼠间发病机制异同
Dev cell | 同济大学王平组揭示肿瘤干细胞调控的新机制
Cell Reports:多维组学揭示年龄改变影响胰岛β细胞代谢重编程的机制
肿瘤分子分型
转化应用
Nature Reviews:大数据用于炎症性肠病研究,前景广阔(综述)
植物
PLOS Genetics:蛋白质SUMO化修饰调控植物次生细胞壁增厚新机制
微生物
Microbiome:蛋白质组学揭示抗生素会提高农药暴露风险
Nature最新突破,大脑皮质神经元投射的亚细胞转录组和蛋白质组研究
疾病与表观遗传
生殖医学
病毒与免疫
Hepatology:泛素结合酶UBE2L3调控乙型肝炎病毒cccDNA稳定性的新机制
Cancer Cell:多维组学整合分析,揭示早期胃癌的分子特征

邹文安