有用的来了，植物蛋白翻译后修饰数据库Plant PTM Viewer，请收藏

原文/植物科学最前沿

报道/景杰学术

蛋白质的翻译后修饰（Post-translational modifications ，PTMs）是细胞信号的核心内容，其重要性不言而喻。随着质谱技术的发展，越来越多的翻译后修饰位点被发现。

4月20日，Plant Journal在线发表了题为“The Plant PTM Viewer, a central resource for exploring plant protein modifications”的研究论文，公布了植物蛋白翻译后修饰的数据库。

数据库中包含来自于5种不同物植物大约370,000个PTM位点的19种蛋白质修饰。

5种植物分别为：

Arabidopsis thaliana（拟南芥） : 100,623 PTMs in 41,409 proteins
Chlamydomonas reinhardtii （莱茵衣藻）: 17,064 PTMs in 5,324 proteins
Oryza sativa ssp. japonica（水稻） : 56,606 PTMs in 19,500 proteins
Triticum aestivum（小麦） : 53,580 PTMs in 25,150 proteins
Zea mays （玉米）: 143,869 PTMs in 37,099 proteins

该网站还为用户提供了一个蛋白质序列概览，其中突出显示了实验证明的翻译后修饰位点，并估计了置信度，还可以确定实际的修饰位点，以及功能蛋白域或活性位点残基。

还具有BLAST功能，可以搜索同源序列中的保守翻译后修饰位点，直接粘贴序列就可以了！

Plant PTM Viewer网址：（点击阅读原文链接至数据库）

http://www.psb.ugent.be/PlantPTMViewer 

参考文献：Patrick Willems, et al., 2019, The Plant PTM Viewer, a central resource for exploring plant protein modifications. Plant Journal.

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