邹文安
典型案例-靶向蛋白质组技术PRM
1.Nature：精准绘制人类血浆蛋白质组遗传图谱
研究人员研究了与特定分子靶点结合的 DNA 短链，分析 了3301 人的血液样本中的 3622 种蛋白质（如图1）。通过基于高分辨率质谱的deep蛋白质组学技术实现对于血液中的低丰度蛋白检测，再利用靶向蛋白质组技术（PRM）对鉴定到的蛋白表达情况进行验证，确保验证结果与组学数据一致，有效避免假阳性结果的干扰。
图1.血浆蛋白组分析
a. 所有检测到的血浆蛋白与人类蛋白谱的比较.
b.GO分子功能分析.
2.Theranostics：血液蛋白质组学开发精准诊断蛋白标志物组合
研究者首先选取了16例慢性乙肝病人（CHB），19例乙肝病毒引发的慢加急性肝衰竭患者（HBV-ACLF），10例正常人对照，进行高通量蛋白质组学研究去揭示ACLF相关的血浆蛋白质组的变化。
接下来作者通过统计学与生物信息学方法挑选了28个与ACLF临床表型相关且肝特异性较好的候选标志物并在77个健康人对照、92个CHB病人、71个HBV-ACLF患者群体中运用靶向蛋白质组学进行验证。随后将筛选鉴定的潜在标志物与临床指标进行联合分析进而鉴定ACLF临床诊断和预后的蛋白质标志物组合指标。
图1. 利用蛋白质组学鉴定和开发ACLF相关蛋白标志物的研究思路
详细解读：专家评述 | 浙大一附院李兰娟院士团队基于血液蛋白质组学开发慢加急性肝衰竭精准诊断蛋白标志物组合
3.Cell Reports：蛋白质组学评估人多能基质细胞的再生能力
首先通过定量蛋白质组学评估hMSC细胞系的β细胞再生潜能，随后运用蛋白质定量组学鉴定hMSC细胞系分类的蛋白质标记，最后运用靶向蛋白组学（PRM技术）、功能验证等对β细胞再生hMSCs中鉴定到的预测蛋白进行验证，是蛋白质组学运用于生物标记物筛选与鉴定的典型案例。
图3 靶向蛋白组学对鉴定到的潜在蛋白进行验证
详细解读：Cell Reports：蛋白质组学评估人多能基质细胞的再生能力
4.JCP：乙酰化修饰组学揭示致病真菌抑菌新机制
靶向蛋白质组学技术（PRM）对筛选的14个差异蛋白进行验证，结果（如表1）显示PRM验证结果与label-free定量结果高度一致。这也表明，靶向蛋白质组学技术可以很好的替代传统的WB进行蛋白质表达差异验证。更值得一提的是，PRM技术在合成多肽的前提下最多可以一次验证30个差异蛋白，这也正是PRM更有可能直接应用于临床的主要原因。
表1.label-free与PRM定量结果比较
详细解读：乙酰化修饰组学揭示致病真菌抑菌新机制
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