蛋白质组学(Proteomics)是指全面分析生物体或细胞蛋白质整体状态的系统生物学技术。作为“后基因组”时代的核心内容之一,蛋白质组学直接全面解析样本蛋白质丰度或翻译后修饰水平,发现基因与转录水平无法确定的蛋白质功能、互作关系等调控机理,对于病理、毒理学、药物动力学等具有重要价值。
基于此,景杰学术团队整理部分毒理蛋白质组学及相关亮点研究成果,以飨读者。
1 Nat Comm | 新型组蛋白翻译后修饰——异烟酰化修饰
异烟肼 (Isoniazid,INH) 是一种一线抗结核药物,但具有显著肝毒性,能够诱发肝衰竭及大鼠肝癌。北京大学基础医学院、国际癌症研究院张宏权教授团队在Nature Communications(IF=14.919)杂志发文,首次报道INH及其代谢产物诱导组蛋白发生翻译后修饰——赖氨酸异烟酰化(Kinic)。景杰生物作为合作单位参与此次研究,并为该研究提供抗体开发与蛋白组学技术支持。
为阐释INH的肝脏毒理产生机制,研究人员收集了10种不同类型的肿瘤组织和邻近正常组织进行免疫组化染色来确定组织中的Kinic水平。揭示INH诱导的组蛋白Kinic激活了PI3K/Akt/mTOR信号通路,提供了组蛋白Kinic与癌症发展相关的潜在联系。
新型组蛋白翻译后修饰——异烟酰化修饰
2 Sci Adv | 巴豆酰化与DNA损伤修复
研究揭示巴豆酰化修饰蛋白,广泛参与了 RNA 剪接、蛋白质合成降解、DNA 复制和修复、内吞作用、细胞间连接等多种生物学过程。后继功能研究进一步证明了巴豆酰化修饰与 DNA 损伤修复密切相关。DNA代谢过程的关键蛋白RPA1上面的巴豆酰化对于DNA损伤条件下的细胞生存非常重要。
CDYL 介导 RPA1 的巴豆酰化调控 DNA 损伤修复
3 ENVIRON SCI-NANO | 碳纳米管和抗生素对蓝藻的复合毒性机理
差异蛋白KEGG代谢通路富集分析
4 JHM | 蚯蚓蛋白组与生态毒性响应新进展
砷可降低过氧化氢酶和超氧化物歧化酶活性,然而对其蛋白质水平全景式的毒性作用机制知之甚少。南京土壤所王兴祥团队在环境科学权威期刊Journal of Hazardous Materials(IF=10.588)上发文,运用TMT标记的蛋白组学定量方法,比较低浓度砷污染土壤和正常土壤中的蚯蚓,揭示了低浓度砷污染土壤严重干扰了蚯蚓的渗透平衡代谢和免疫系统。
研究发现低浓度砷污染处理后的蚯蚓后肠富集高浓度砷,对肠道上皮细胞、黄色细胞和体腔组织造成不同程度的损伤。进一步蛋白质组学研究共定量到5457个蛋白,树状聚类法显示砷处理诱导了29个上调和29个下调的差异表达蛋白,调控渗透代谢的可溶性钙绑定蛋白、抑制蛋白、钠/钾转运ATP酶等以及参与免疫功能的甘氨酸-tRNA连接酶显著变化。证实了低浓度砷污染土壤严重干扰了蚯蚓的渗透平衡代谢和免疫系统。
低浓度砷污染土壤诱导蚯蚓毒性的蛋白质组学分析
2021-10-14
2021-10-09
2021-09-23
2021-09-09
2021-04-16
参考文献
Yuhan Jiang, et al., 2021, Isonicotinylation is a histone mark induced by the anti-tuberculosis first-line drug isoniazid. Nature Communications.
Yu H, et al., 2020, Global crotonylome reveals CDYL-regulated RPA1 crotonylation in homologous recombination-mediated DNA repair. Science Advances.
Mingtao You, et al., 2021, Carbon nanotubes influence the toxic effects of chloramphenicol and tetracycline on cyanobacterium Synechocystis sp. in different ways. Environmental Science: Nano.
RongguiTang, et al., 2020, A new perspective on the toxicity of arsenic-contaminated soil: Tandem mass tag proteomics and metabolomics in earthworms. Journal of Hazardous Materials.

邹文安