邹文安
CUT&Tag技术的全称是Cleavage Under Targets and Tagmentation，是一种验证DNA-蛋白互作的全新技术，是CUT&RUN的2.0版本。CUT&Tag完全颠覆传统ChIP-seq（染色质免疫沉淀-测序）的操作流程，它能够高效、准确地检测细胞中的蛋白质与DNA之间的相互作用。
CUT&Tag
CUT&Tag技术的原理是在抗体引导下，Tn5酶仅在目的组蛋白修饰标记、转录因子或染色质调控蛋白结合染色质的位置进行目的DNA的片段化，同时添加测序接头。相比传统的ChIP-seq技术，CUT&Tag技术具有许多优势，如信噪比高，可重复性好，细胞投入量低等。
01
信噪比高
CUT&Tag使用2M的测序量可实现媲美十倍测序量的ChIP-seq实验结果。
02
实验周期短
可在1天内完成从细胞到文库构建的全流程，简直就是效率提升神器。
03
低样本需求
尤其适用于早期胚胎发育、干细胞等细胞材料获取困难的实验。
CUT&Tag技术的强大优势为生命科学研究开辟了新的道路，可应用于研究转录因子的结合位点、染色质三维结构、表观遗传修饰等方面。CUT&Tag的实验流程主要可以分为以下几个步骤：
图1 CUT&Tag的实验流程
下面我们通过对比CUT&Tag，CUT&RUN与传统的ChIP-seq在不同方面的差异，来看下三者的区别和各自的优势。
表1.ChIP-seq、CUT&RUN与CUT&Tag的比较（红色表示该技术的优点）
与ChIP-seq类似，CUT&Tag成败的关键因素之一是抗体的选择，因为其是精准指导Tn5结合基因组位置的重要因素。小编在日常工作也常常被问到，你们的某某抗体能不能做CUT&Tag。CUT&Tag的发明人Henikoff教授在一次讲座中提到CUT&Tag抗体在实验中的角色更接近于免疫荧光中的抗体角色。但是实践出真知，只有经过实验验证的应用我们才敢放心推荐。这不，我们的研发狠一狠心，咬一咬牙，搭建了CUT&Tag技术平台。
首先为大家测试的是就是众望所归的组蛋白乳酸化修饰抗体（PTM-1427RM和PTM-1415RM），仅仅用了3M的数据量，就得到非常漂亮的peak。
图2 PTM-1427RM 和PTM-1415RM的CUT&Tag 的IGV结果展示（3M reads结果）
乳酸化修饰是当今最受欢迎的新型酰化修饰类型，参与了多个生物学过程，包括细胞代谢、细胞信号传导、基因表达调控和疾病发展等。乳酸化修饰研究为我们理解细胞功能和疾病机制提供了重要的线索，并为开发相关的治疗策略和药物提供了潜在的靶点。在表观研究领域，H3K18是目前研究最多的组蛋白乳酸化修饰位点，也是众多老师研究组蛋白乳酸化的首选位点。以下是一个使用H3K18la抗体进行CUT&Tag的研究案例。
研究案例 H3K18乳酸化修饰是组织特异的活跃增强子
该研究鉴于乳酸化修饰的重要性，对多个样本（包括小鼠胚胎干细胞、巨噬细胞、脂肪细胞以及小鼠和人类骨骼肌）进行针对H3K18乳酸化修饰的CUT&Tag实验，并与前期研究中其他组蛋白修饰和基因表达模式进行比较。结果发现，H3K18la富集于与相应组织的功能重要基因靠近的活性增强子，暗示其不仅是活性启动子的标记，而且是组织特异性活性增强子的标记。
图3 H3K18la与不同组织中增强子信号存在较高程度的重合情况
在本文中所用的巨噬细胞为Bone-marrow-derived macrophage (BMDM),该材料源于从股骨和胫骨中冲洗出骨髓前体细胞，所以收集到的细胞非常有限，CUT&Tag技术让细胞量少的问题的迎刃而解。
当最火的乳酸化修饰遇到最新的CUT&Tag技术，你确定不冲吗？
往期推荐：
1.靶点介绍|一文带你了解免疫检查点
2.一站式IP打造|第二弹.一文搞定IP三大疑难杂症
3.一站式IP打造|第一弹.IP全流程解析
END
作为修饰型抗体的领跑者，景杰生物PTMab®抗体致力为全球科研工作者、药物研发客户以及体外诊断客户提供高品质抗体试剂及抗体定制服务，助力加速科学研究及应用转化。PTMab®产品涵盖蛋白质修饰泛抗体、组蛋白修饰型抗体、位点特异性抗体以及重组蛋白等。产品广泛应用于表观遗传学领域、肿瘤免疫学领域、发育及代谢领域、神经生物学领域及体外诊断领域。PTMab®产品的应用文章多次在Cell、Nature、Science等顶级期刊及其子刊上发表，备受客户信赖。
公众号名片模板，只能用同步方式上传到公众号后台