Uniprot中隐藏的神器—ID Mapping | 景杰学术

Uniprot中隐藏的神器—IDMapping......

邹文安邹文安2025-06-25
Uniprot中隐藏的神器—ID Mapping | 景杰学术
上一期小编带大家了解了几种常见的数据库ID,这期小编将在之前的基础上介绍3个主要ID之间的转换方式。
转换的秘密武器就隐藏在最常见的UniProt网站中~
首先,我们登陆UniProt官网。
(https://www.uniprot.org/)
从首页就可以直接看到这次的主角,Retrieve/ID Mapping~
那么,如何使用Retrieve/ID Mapping工具?
Step1:检索相应的UniProt条目并下载;如需要将其他数据库蛋白ID转换为UniProt ID,也是需要先下载相应的ID列表;
Step2:输入或上传一系列蛋白ID、Entry name等,注意用空格或新建行来分隔;如P31946、P62258、ALBU_HUMAN、EFTU_ECOLI。

Step3:从下拉菜单中选择来源蛋白类型(From)和目标转换类型(To)。

附上常见的几种类型。
Step4:单击提交按钮。

下面我们就通过实例(UniProt ID—RefSeq Protein)来演练一下~
首先,准备好需要进行转换的蛋白ID,可以先汇总到excel表中备用。
把关注的蛋白ID直接复制粘贴到框内。

其次,需要明确两个要素:
1/ 前期输入的蛋白是来源于哪个数据库,属于哪个类型;
——From下拉框内选择“UniProtKB AC/ID”
2/ 希望将已知的ID转换为哪个数据库 ID,或者转换为哪个类型。
——To下拉框内选择“RefSeq Protein”

最后,点击“Submit”,等待结果….

根据结果显示,我们提交的15个蛋白中有14个成功的匹配到39个RefSeq的蛋白ID,可以点击“Download”直接下载保存~
如果您认为结果与预期不一致,也可以回退重新选择转换类型~
比如说转换为Ensembl或者Ensembl Protein:

利用好网站上的这些隐藏神器,可以非常巧妙地帮助到自己的科研分析。小编接下来也会继续努力,多多发掘神器,助力各位。
 

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