上一期小编带大家了解了几种常见的数据库ID,这期小编将在之前的基础上介绍3个主要ID之间的转换方式。转换的秘密武器就隐藏在最常见的UniProt网站中~(https://www.uniprot.org/)从首页就可以直接看到这次的主角,Retrieve/ID Mapping~那么,如何使用Retrieve/ID Mapping工具?Step1:检索相应的UniProt条目并下载;如需要将其他数据库蛋白ID转换为UniProt ID,也是需要先下载相应的ID列表;Step2:输入或上传一系列蛋白ID、Entry name等,注意用空格或新建行来分隔;如P31946、P62258、ALBU_HUMAN、EFTU_ECOLI。
Step3:从下拉菜单中选择来源蛋白类型(From)和目标转换类型(To)。

下面我们就通过实例(UniProt ID—RefSeq Protein)来演练一下~首先,准备好需要进行转换的蛋白ID,可以先汇总到excel表中备用。
1/ 前期输入的蛋白是来源于哪个数据库,属于哪个类型;——From下拉框内选择“UniProtKB AC/ID”2/ 希望将已知的ID转换为哪个数据库 ID,或者转换为哪个类型。——To下拉框内选择“RefSeq Protein”

根据结果显示,我们提交的15个蛋白中有14个成功的匹配到39个RefSeq的蛋白ID,可以点击“Download”直接下载保存~如果您认为结果与预期不一致,也可以回退重新选择转换类型~比如说转换为Ensembl或者Ensembl Protein:

利用好网站上的这些隐藏神器,可以非常巧妙地帮助到自己的科研分析。小编接下来也会继续努力,多多发掘神器,助力各位。长按扫描二维码↓↓,了解更多【人工客服】、【项目查询】、及其他方法案例干货。返回文章列表