测评报告---TMT 16plex蛋白质组学拥有更强大的定量能力

近些年来，随着技术的不断发展，针对蛋白质组学研究已经开发出多种定量方法。目前较主流的定量蛋白质组学方法包括Label-free、TMT/iTRAQ、SILAC，PRM等，其中TMT体外标记定量方法因其适用范围广、定量平行性好而成为基础科研中最为常用的定量技术之一。

然而TMT的标签数目有限，当样本数在10个以内时，可以利用TMT实现一次性标记上机检测。但如果样本数更多，就需要添加“搭桥”的样品，然后分不同的标记组并分批上样。这样操作虽然解决了标签数目太少不能满足所有样本在同一组标记的难题，但却引入了多批次上样所带来的平行性不好、数据丢失、鉴定深度受影响等问题，还会引起明显的“批次效应”，使其定量的可靠性大打折扣。这是TMT标签定量最大的局限性。而就在近期，该定量方法在技术上取得了新的突破。

这种突破首先源自于新的多通道标记定量试剂的推出，我们最新引进的TMTpro标签试剂可实现一次性多达16个样本的蛋白质组定量分析（图1），并且具有更好的适用性、更优的定量比例和平行性。

 图1. TMTpro 16plex标记蛋白质组流程

以15个样本（5组3重复）标记定量蛋白质组学检测为例，传统的标记方法是5个样本标记为一组，共3组。三次分批上样后会导致平行性不好，鉴定的蛋白有差异，定量比例降低。我们最新的实验数据显示，三组重复实验鉴定到的蛋白数目分别为6468、6596和6444，而共同定量蛋白数目只有5317。相比之下，新的TMT16标可以实现一次性对15个样本进行标记并同批上样，没有数据缺失问题，有效定量数目更高（图2）。

然而，更多的通道数也会带来一个弊端，那就是标签之间的质量差很小，需要质谱仪采用更高的分辨率而牺牲扫描速度，导致了鉴定深度的下降。这种试剂化学结构特点所引起的问题，可以通过质谱上新的技术来解决。在最新的Exploris480仪器中，搭载了TurboTMT的功能，通过特定的算法能够在高扫描速度下依然分辨出不同的标签质量。根据实测结果，在480平台上开启该功能之后，相比传统平台定量蛋白数提高近1000个（图2）。

图2. TMTpro 16plex和传统TMT标记蛋白质组比较

我们的数据表明，TMT 16plex标记蛋白质组学再度扩展了标记定量的能力，能够支持更大规模样本、更加灵活的实验设计，为基础研究提供了新的强大工具。

如果您想了解TMT 16plex标记蛋白质组学更多相关产品信息，，请咨询景杰生物销售工程师或拨打客服热线（400-100-1145）。

长按扫描二维码↓↓，了解更多【人工客服】、【项目查询】、及其他方法案例干货。